В январе 2001 года был приглашен руководителями РОО "Демократический Выбор Казахстана" (М. Аблязовым и Г. Жакияновым) в Алматы, для организации пресс-службы и PR- деятельности общественного объединения. В 2003 году был избран членом Политсовета РОО ДВК, в 2004 году — членом Бюро Политсовета НП ДВК. С 2005 года — член Президиума Политсовета НП "АЛFА!" (ДВК), член Президиума Политсовета РОО "Блок демократических сил "За справедливый Казахстан". С 2007 года был председателем Координационного комитета партии "Алга!".

23 января 2012 года был арестован спецслужбами Казахстана, его обвиняли по ст. 164, ч. 3 УК РК из-за событий в Жанаозене. Владимир Козлов оказался за решеткой через месяц после Жанаозенских событий. Ему вменили "возбуждение социальной розни" за поддержку бастовавших нефтяников, которые на протяжении семи месяцев стояли на площади Жанаозена, требуя повышения зарплат, улучшения условий труда, и всё это время оставались не услышанными в столице. 16 декабря 2011 года забастовку подавили силой. В тот день полиция открыла огонь на поражение из табельного оружия.

Правозащитники признали его преследование политически мотивированным. Организация Human Rights Watch сделала заявление, в котором правозащитники осудили решение суда по делу Владимира Козлова. "Осуждение оппозиционного лидера Владимира Козлова на семь с половиной лет тюрьмы наносит удар по свободе выражения мнений и политического плюрализма в Казахстане", — говорилось в заявлении Human Rights Watch. Его осудили на 7,5 лет.

4 августа 2016 года решением Капчагайского городского суда Алматинской области вынесено решение об условно-досрочном освобождении Владимира Козлова.

В настоящее время он вместе с семьей живет в Киеве.